Действие Sky World происходит в одноименном мире MMORPG — Sky World. Однажды тысячи игроков проснулись и оказались в мире.

Дзюнъитиро Микимори — один из этих игроков, который теперь переехал жить в Небесный мир. История начинается с Дзюнъитиро на острове Алтария. Там он встречает женскую гильдию и подружится с двумя ее членами.Вместе они решают покинуть остров Алтария и отправиться на самую высокую точку мира: остров Айон, в надежде найти путь обратно в реальный мир.